Ashkenazim Son FFPE Reference Standard curl

Ashkenazim Son FFPE-Referenzstandard Curl ist ein hervorragend charakterisiertes humanes FFPE-Material, das aus einer menschlichen Zelllinie erzeugt wurde. Hergestellt für FFPE (Gewebe)-Tests in Ihrem Diagnostiklabor oder Ihrer F&E-Abteilung. Informationen über den Mutationsstatus spezifischer Gene und Whole Genome Sequencing (WGS)-Daten sind über das Personal Genome Project (PGP) und unsere eigene Qualitätssicherung frei zugänglich.

Artikelnummer: SID-000100 Kategorie:

Produktinformation

Diese Produkte sind in idealer Weise geeignet für digitale PCR und/oder Next Generation Sequencing (NGS). Insbesondere zur
– Validierung und Entwicklung von Sequenzierprotokollen (z.B. Amplicon Sequencierung) und PCR-Protokollen
– zur Bestimmung der Nachweisgrenze der Methode
– zur Extraktionskontrolle

– routinemäßige Leistungsüberwachung (Nur für Forschungszwecke)

Produktübersicht

Format: FFPE (Formalin Fixed Paraffin Embedded)

Menge pro Verkaufseinheit: 5 FFPE Schnitte (gerollt)

Menge pro Röhrchen: 1 FFPE Schnitt (gerollt)

Erwartete DNA Menge pro Röhrchen: ≥ 400 ng / Schnitt bei Verwendung von Qiagen AllPrep DNA/RNA FFPE kit

Erwartete RNA Menge pro Röhrchen: ≥ 400 ng / Schnitt bei Verwendung von Qiagen AllPrep DNA/RNA FFPE kit

Schnittdicke: 10 µm

Mutationen:

Wildtyp für die meisten Tumorrelevanten Mutationen. Das Genom wurde über verschiedene Verfahren sequenziert (s.u.) und auf spezifische Mutationen mittels ddPCR orthogenal getestet.

Allelfrequenz: Nein

Lagerung: 2-8 °C

Haltbarkeit: 24 Monate nach Herstellungsdatum

Qualitätssicherung (DNA)

Allelfrequenz/Kopienzahl (metrologisch rückverfolgbar): ddPCR (Bio-Rad)

Quantifizierung (metrologisch rückverfolgbar): fluorometrische dsDNA Messung (QuBit)

DNA Quality: Agarose Gelelectrophorese

Qualitätssicherung (RNA)

Quantifizierung: fluorometrische RNA Messung (Qubit)

Qualitätssicherung (weitere)

Zelldichte:

1. Visuell über Durchlichtmikroskopie

2. kalibrierte Messung

Technischer Hintergrund

Ursprung:
The Genome In A Bottle (GIAB) cell line from the Personal Genome Project (PGB): GM24385 (HG002- NA24385 – huAA53E0)

Bioinformatik:
– Lot specific sequencing files: LOT Search
– High-confidence variant calls: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/release/AshkenazimTrio
– Raw datasets and bam files, currently including 10X Genomics, BioNano, Complete Genomics regular and LFR, 300x Illumina paired-end, Illumina 6kb mate-pair, 1000x Ion exome, custom molecular libraries, ~0.05x Oxford Nanopore, and 70x/30x/30x PacBio: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/data/AshkenazimTrio/HG002_NA24385_son/

*GRCh38 COSMICv90

Dokumente

Analysenzertifikat (COA):


Lot: 00060

Sicherheitsdatenblatt (SDS):

Gebrauchsanweisung (IFU)