Ashkenazim son cfDNA in Plasma (EGFR)

„Ashkenazim son cfDNA in Plasma“ ist dem Menschen nachempfundenes Plasma mit einer spezifischen Menge an cfDNA / ctDNA. Es enthält alle relevanten Komponenten humanen Plasmas nach Blutabnahme und Plasmaseparation: Humane Proteine in üblicher Plasmakonzentration, Elektrolyte & EDTA. Die EDTA Konzentration in allen Plasmaprodukten richten sich an die Empfehlungen der ICSH (International Council Society of Haematology) und der CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) für EDTA in Blutentnahmeröhrchen.

Artikelnummer: SID-0002-1 Kategorie:

Produktinformation

Empfohlene Nutzung:
1. Extraktionskontrolle (z.B. bei Gerätequalifizierungen)
2. Spike-In Experimente mit synthetischen cfDNA Fragmenten
3. Kontrolle bei Workflow-Validierungen (NGS, PCR, …)
4. Negativkontrolle für EGFR Mutationen (p.G719S, p.E746_A750delELREA, p.S752_I759delSPKANKEI, p.S768I, p.V769_D770insASV, p.T790M, p.L858R, p.L861Q)

Fragment Größe (Peak):
~167 bp

Menge pro Einheit:
80 ng/ml (total 400 ng)

AA Change (Cosmic ID, Mutation type, HGVS Nomenklatur, Exon)

  • p.G719S (COSM6252*, Substitution, c.2155G>A, Exon 18)
  • p.E746_A750delELREA (COSM6225*, Deletion, c.2236_2250del15, Exon 19)
  • p.S752_I759delSPANKEI (COSM6256*, Deletion, c.2254_2277del24, Exon 19)
  • p.S768I (COSM6241*, Substitution, c.2303G>T, Exon 20)
  • p.V769_D770insASV (COSM20884*, Insertion, c.2303_2304ins9, Exon 20)
  • p.T790M (COSM6240*, Substitution, c.2369C>T, Exon  20)
  • p.L858R (COSM6224*, Substitution, c.2573T>G, Exon 21)
  • p.L861Q (COSM6213*, Substitution, c.2582T>A, Exon 21)

Allelfrequenz
0%

Puffer:
humanes Plasma (human-tech)

Erwartete DNA Ausbeute:
Info folgt

Lagerung:
2-8 °C

Haltbarkeit:
stabil bis 12 Monate nach Herstellungsdatum (wie geliefert)

Qualitätssicherung

Fragment Größe:
High Sensitivity DNA Kit Agilent

Allelfrequenz:
dPCR

Quantifizierung:
UV-Vis Spectrophotometry (NIST-Referenzmethode)

Technischer Hintergrund

Ursprung:
cell line GM24385 (HG002- NA24385 – huAA53E0)

Bioinformatik:
– lot specific sequencing files: LOT Search
– High-confidence variant calls: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/release/AshkenazimTrio
– Raw datasets and bam files, currently including 10X Genomics, BioNano, Complete Genomics regular and LFR, 300x Illumina paired-end, Illumina 6kb mate-pair, 1000x Ion exome, custom moleculo libraries, ~0.05x Oxford Nanopore, and 70x/30x/30x PacBio: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/data/AshkenazimTrio/HG002_NA24385_son/

 

Dokumente

Analysenzertifikat:

Batch Certificate


Lot: 00006

weitere Dokumente:

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Gebrauchsanweisung