5-Gene-Multiplex Set cfDNA in Plasma, BRAF/KRAS/PIK3CA/AKT1/ERBB2; AF: 0%; 0,1%; 1%; 5%

Die ausgesuchten Gene und Mutationen sind diagnostisch und therapeutisch von hoher relevanz und spielen außerdem eine Rolle bei verschiedensten Tumorentitäten:

Breast Carcinoma,  Colorectal Carcinoma,  Melanoma, Non-Small Cell Lung Carcinoma,  Small Cell Lung Carcinoma,  Prostate Carcinoma,  Lymphoma,  Head and Neck Carcinoma,  Hepatocellular Carcinoma,  Multiple Myeloma,  Pancreatic Adenocarcinoma,  Ovarian Carcinoma,  Bladder Carcinoma, Bile Duct Carcinoma und weiteren.

Das 5-Gene-Multiplex Set cfDNA in Plasma Produkt kann in der Diagnostik als Allelfrequenz Standardreihe in Liquid Biopsy Untersuchungen in ihrem Labor oder F&E-Abteilung eingesetzt werden, sowie zur Validierung und Entwicklung von diagnostischen Testkits. Als Hintergrundmaterial dient humane cfDNA der Ashkenazim Son Zelllinie. Das Set besteht aus den Einzelprodukten SID-000002, SID-000088, SID-000089 sowie SID-000090, sodass sie ihren Prozess mit 0%, 0,1%, 1% und 5% Allelfrequenz qualitativ und auch quantitativ validieren können.

Artikelnummer: SID-000091 Kategorie:

Produktinformation

Diese Produkte sind in idealer Weise geeignet für digitale PCR und/oder Next Generation Sequencing (NGS). Insbesondere zur
– Validierung und Entwicklung von Sequenzierprotokollen (z.B. Amplicon Sequencierung) und PCR-Protokollen
– zur Bestimmung der Nachweisgrenze der Methode
– zur Extraktionskontrolle

Menge pro Einheit:
80 ng/ml (gesamt 400 ng)

Fragment Größe (Peak)
~167 bp

Mutation:

  • AKT1 – p.E17K (COSV62571334*, Substitution, c.49G>A)
  • BRAF – p.V600E (COSV56056643*, Substitution, c.1799T>A)
  • ERBB2 – p.Y772_A775dup (COSV54062409*, Insertion, c.2323_2324dup)
  • KRAS – p.G12D (COSV55497369*, Substitution, c.35G>A)
  • KRAS – p.Q61K (COSV55502066*, Substitution, c.181C>A)
  • KRAS – p.A146T (COSV55501778*, Substitution, c.436G>A)
  • PIK3CA – p.E545K (COSV55873239*, Substitution, c.1633G>A)
  • PIK3CA – p.H1047R (COSV55873195*, Substitution, c.3140A>G)

Allelfrequenz:
0%; 0,1%; 1%; 5%

Puffer:
humanes Plasma (human-tech)

Lagerung:
2-8 °C

Haltbarkeit:
stabil bis 12 Monate nach Herstellungsdatum (wie geliefert)

Qualitätssicherung

Fragmentgröße:
High Sensitivity DNA Kit Agilent

Allelfrequenz/Kopienzahl (metrologisch rückverfolgbar):
dPCR

Quantifizierung (metrologisch rückverfolgbar):
1. UV-Vis Spectrophotometry (NIST-Referenzmethode) zur Messung der gesamt DNA

2. dsDNA Messung

Technischer Hintergrund

Ursprung:
cell line GM24385 (HG002- NA24385 – huAA53E0)

Bioinformatik:
– lot specific sequencing files: LOT Search
– High-confidence variant calls: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/release/AshkenazimTrio
– Raw datasets and bam files, currently including 10X Genomics, BioNano, Complete Genomics regular and LFR, 300x Illumina paired-end, Illumina 6kb mate-pair, 1000x Ion exome, custom molecular libraries, ~0.05x Oxford Nanopore, and 70x/30x/30x PacBio: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/data/AshkenazimTrio/HG002_NA24385_son/

*GRCh38 COSMICv90

Dokumente

Analysenzertifikat:

Batch Certificate

weitere Dokumente:

Sicherheitsdatenblatt

Gebrauchsanweisung