5-Gene-Multiplex Set cfDNA in Plasma, BRAF/KRAS/PIK3CA/AKT1/ERBB2; AF: 0%; 0,1%; 1%; 5%

Die ausgesuchten Gene und Mutationen sind diagnostisch und therapeutisch von hoher relevanz und spielen außerdem eine Rolle bei verschiedensten Tumorentitäten:

Breast Carcinoma, Colorectal Carcinoma, Melanoma, Non-Small Cell Lung Carcinoma, Small Cell Lung Carcinoma, Prostate Carcinoma, Lymphoma, Head and Neck Carcinoma, Hepatocellular Carcinoma, Multiple Myeloma, Pancreatic Adenocarcinoma, Ovarian Carcinoma, Bladder Carcinoma, Bile Duct Carcinoma und weiteren.

Das 5-Gene-Multiplex Set cfDNA in Plasma Produkt kann in der Diagnostik als Allelfrequenz Standardreihe in Liquid Biopsy Untersuchungen in ihrem Labor oder F&E-Abteilung eingesetzt werden, sowie zur Validierung und Entwicklung von diagnostischen Testkits. Als Hintergrundmaterial dient humane cfDNA der Ashkenazim Son Zelllinie. Das Set besteht aus den Einzelprodukten SID-000002, SID-000088, SID-000089 sowie SID-000090, sodass sie ihren Prozess mit 0%, 0,1%, 1% und 5% Allelfrequenz qualitativ und auch quantitativ validieren können.

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Artikelnummer: SID-000091 Kategorie: Plasma + cfDNA / ctDNA

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Produktinformation

Verfügbar als maßgeschneidertes Produkt nach Ihren Bedürfnissen hergestellt: Von der Lieferung in großen Mengen und kundenspezifischen Chargengrößen bis hin zum selbst hergestellten Produkt mit der entsprechenden cfDNA im Puffer!

OEM-Optionen:

Wenn Sie Materialien als Kit-Kontrollen oder als Drittanbieter-Kontrollen für die Validierung Ihrer Kits in Kundenlabors benötigen, kontaktieren Sie uns bitte über: sales@sens-id.com

Selbst hergestellte Option:

So stellen Sie Ihr vollständiges Plasmakontrollmaterial für den Arbeitsablauf her:

Wenn Sie es vorziehen, Ihre eigenen Full-Workflow-Kontrollen herzustellen, empfehlen wir die Verwendung unserer DNA-depletierten Plasmaprodukte. Mischen Sie die DNA nach Bedarf mit dem DNA-abgereicherten Plasma, um Plasmamaterialien mit den erforderlichen DNA-Konzentrationen zu erhalten.

Dieses Produkt als cfDNA in Puffer finden Sie hier:

5-Gene-Multiplex Set SID-000095

Kombinieren sie die cfDNA in Puffer mit:

Und stellen Sie Ihre eigenen Plasmamaterialien her.

Diese Produkte sind in idealer Weise geeignet für digitale PCR und/oder Next Generation Sequencing (NGS). Insbesondere zur
– Validierung und Entwicklung von Sequenzierprotokollen (z.B. Amplicon Sequencierung) und PCR-Protokollen
– zur Bestimmung der Nachweisgrenze der Methode
– zur Extraktionskontrolle

Menge pro Einheit: nach Wunsch

Fragment Größe (Peak)
~167 bp

Mutation:

AKT1 – p.E17K (COSV62571334*, Substitution, c.49G>A)
BRAF – p.V600E (COSV56056643*, Substitution, c.1799T>A)
ERBB2 – p.Y772_A775dup (COSV54062409*, Insertion, c.2323_2324dup)
KRAS – p.G12D (COSV55497369*, Substitution, c.35G>A)
KRAS – p.Q61K (COSV55502066*, Substitution, c.181C>A)
KRAS – p.A146T (COSV55501778*, Substitution, c.436G>A)
PIK3CA – p.E545K (COSV55873239*, Substitution, c.1633G>A)
PIK3CA – p.H1047R (COSV55873195*, Substitution, c.3140A>G)

Allelfrequenzen: 0%; 0,1%; 1%; 5%

Puffer: humanes Plasma (human-tech)

Lagerung: 2-8 °C

Haltbarkeit:
stabil bis 24 Monate nach Herstellungsdatum (wie geliefert). Bei eigener Herstellung ist dies abhängig von Herstellbedingungen

Qualitätssicherung

Fragmentgröße: High Sensitivity DNA Kit Agilent

Allelfrequenz/Kopienzahl (metrologisch rückverfolgbar):
dPCR

Quantifizierung (metrologisch rückverfolgbar):

UV-Vis Spectrophotometry (NIST-Referenzmethode) zur Messung der gesamt DNA
dsDNA Messung (Fluorometrisch)

Technischer Hintergrund

Ursprung: cell line GM24385 (HG002- NA24385 – huAA53E0)

Bioinformatik:
– lot specific sequencing files: LOT Search
– High-confidence variant calls: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/release/AshkenazimTrio
– Raw datasets and bam files, currently including 10X Genomics, BioNano, Complete Genomics regular and LFR, 300x Illumina paired-end, Illumina 6kb mate-pair, 1000x Ion exome, custom molecular libraries, ~0.05x Oxford Nanopore, and 70x/30x/30x PacBio: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/data/AshkenazimTrio/HG002_NA24385_son/

*GRCh38 COSMICv90