5-Gene-Multiplex 1% AF cfDNA in Plasma, BRAF/KRAS/PIK3CA/AKT1/ERBB2

Artikelnummer: SID-000089 Kategorie:

Produktinformation

Diese Produkte sind in idealer Weise geeignet für digitale PCR und/oder Next Generation Sequencing (NGS). Insbesondere zur
– Validierung und Entwicklung von Sequenzierprotokollen (z.B. Amplicon Sequencierung) und PCR-Protokollen
– zur Bestimmung der Nachweisgrenze der Methode
– zur Extraktionskontrolle

Menge pro Einheit:
80 ng/ml (total 400 ng) in 5 ml

Fragment Größe (Peak)
~167 bp

Mutationen:

  • AKT1 – p.E17K (COSV62571334*, Substitution, c.49G>A)
  • BRAF – p.V600E (COSV56056643*, Substitution, c.1799T>A)
  • ERBB2 – p.Y772_A775dup (COSV54062409*, Insertion, c.2323_2324dup)
  • KRAS – p.G12D (COSV55497369*, Substitution, c.35G>A)
  • KRAS – p.Q61K (COSV55502066*, Substitution, c.181C>A)
  • KRAS – p.A146T (COSV55501778*, Substitution, c.436G>A)
  • PIK3CA – p.E545K (COSV55873239*, Substitution, c.1633G>A)
  • PIK3CA – p.H1047R (COSV55873195*, Substitution, c.3140A>G)

Allelfrequenz:
1%

Puffer:
humanes Plasma (human-tech)

Lagerung:
2-8 °C

Haltbarkeit:
stabil bis 12 Monate nach Herstellungsdatum (wie geliefert)

Qualitätssicherung

Fragmentgröße:
High Sensitivity DNA Kit Agilent

Allelfrequenz:
dPCR

Quantifizierung:
UV-Vis Spectrophotometry (NIST-Referenzmethode)

Technischer Hintergrund

Ursprung:
cell line GM24385 (HG002- NA24385 – huAA53E0)

Bioinformatik:
– lot specific sequencing files: LOT Search
– High-confidence variant calls: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/release/AshkenazimTrio
– Raw datasets and bam files, currently including 10X Genomics, BioNano, Complete Genomics regular and LFR, 300x Illumina paired-end, Illumina 6kb mate-pair, 1000x Ion exome, custom moleculo libraries, ~0.05x Oxford Nanopore, and 70x/30x/30x PacBio: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/data/AshkenazimTrio/HG002_NA24385_son/

*GRCh38 COSMICv88

Dokumente

Analysenzertifikat:

Batch Certificate

Lot: 00027

weitere Dokumente:

Sicherheitsdatenblatt

Gebrauchsanweisung